云开体育app最新版本-两项大规模的泛癌种基因组分析揭示癌症转移的秘密
2023-05-23
荷兰乌特勒支年夜学医学中间的研究人员近日经由过程对数千个原发性或转移性肿瘤的基因组序列的比力,发现了与分歧癌症类型的疾病进展或医治耐药相干的基因组特点和改变。
这篇题为“Pan-cancer whole-genome comparison of primary and metastatic solid tumours”的论文在5月10日颁发在《Nature》杂志上。通信作者是乌特勒支年夜学医学中间人类遗传学研究员Edwin Cuppen传授。 “这是第一次取得如斯年夜范围的原发性和转移性肿瘤的全基因组测序数据集,”Cuppen博士称。“这些数据是公然的,可用在研究。它们为进一步研究癌症的生物学和进化和新型疗法的开辟供给了新的资本。” 研究人员利用了以同一的样本处置方式取得的全基因组测序数据。他们阐发了7,108个原发性或转移性肿瘤,笼盖71种癌症类型。以后他们重点阐发了14种组织的23种癌症类型(包罗1,914个原发性肿瘤和3,451个转移性肿瘤),这些样本有足够的数据来比力突变景不雅。 研究人员发现,虽然转移性肿瘤的基因组不不变性增添,布局变异程度上升,但瘤内异质性的整体程度有所降落。不外,原发性和转移性肿瘤的基因组差别模式与癌症类型高度相干,而且遭到癌症医治的影响。 他们指出,对肺腺癌等年夜大都癌症类型,原发性和转移性肿瘤的基因组差别相对较小。不外乳腺癌、前列腺癌、甲状腺癌、肾细胞癌和胰腺神经内排泄肿瘤倒是较着的破例,它们在晚期显示出基因组图谱的普遍转变。 值得留意的是,差别较年夜的癌症类型在原发性肿瘤阶段却预后杰出。作者认为,这注解一部门癌症患者中呈现的转移性肿瘤在疾病进展时代轻易产生较着的基因组转变。 一样,初期的医治表露仿佛也影响了转移性肿瘤与原发性肿瘤的基因组差别水平。研究人员称,转移性肿瘤常常包括了已知和可疑的耐药性相干改变,而它们没有呈现在原发性肿瘤中。 Cuppen博士注释说:“这些差别在很年夜水平上取决在所研究的癌症类型,和之前的抗肿瘤医治表露水平。这项泛癌种研究证实了哪些进程和机制是各类癌症同享的,并量化了它们在各个癌症类型中的风行水平。” 统一天,统一研究团队还在《Nature Genetics》杂志上颁发了题为“Genetic immune escape landscape in primary and metastatic cancer”的论文。他们阐发了6,319个原发性肿瘤和转移性肿瘤样本的全基因组序列,重点存眷了协助肿瘤回避免疫系统进犯的遗传特点。 研究人员在年夜约四分之一的肿瘤中发现了遗传免疫逃逸特点。他们指出,虽然这些特点在原发性和转移性肿瘤中呈现的水平整体上相当,但免疫逃逸的频率和具体机制因癌症类型而异,并与特定肿瘤中的突变负荷有关。 Cuppen博士暗示:“我们发现,免疫逃逸的产生率在分歧肿瘤类型之间转变很年夜,在某些肿瘤类型中,只有一种机制存在,而在其他类型中,多个进程都遭到影响。另外,我们发现原发性和转移性肿瘤之间不存在很年夜差别,注解免疫逃逸是一种在肿瘤成长初期取得的特点。” 这项阐发还显示了特定免疫逃逸特点的选择,包罗对影响HLA-I基因座的杂合性丢掉(LOH)事务的选择,这在肿瘤突变负荷(TMB)程度中等或较高的肿瘤中特殊常见。同时,研究团队还在以高甲基化为特点的部门肿瘤中发现了规避免疫系统的怪异方式。 “虽然HLA-I的杂合性丢掉是突变负荷较高肿瘤的最多见机制,可是某些HLA-I等位基因的丢掉明显不足以应对高突变肿瘤的新表位,在这类环境下可能需要一种非靶向云开体育app最新版本的免疫逃逸机制,如拔除抗原呈递。” 参考文献 Martínez-Jiménez, F., Movasati, A., Brunner, S.R. et al. Pan-cancer whole-genome comparison of primary and metastatic solid tumours. Nature (2023). https://doi.org/10.1038/s41586-023-06054-z Martínez-Jiménez, F., Priestley, P., Shale, C. et al. Genetic immune escape landscape in primary and metastatic cancer. Nat Genet 55, 820–831 (2023). https://doi.org/10.1038/s41588-023-01367-1
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